A pesar de las promesas y compromisos adquiridos por representantes de las diferentes administraciones, uno de los mayores problemas para el Mar Menor, la llegada de grandes aportes de nitratos de origen agrícola, procedentes de la agricultura intensiva del Campo de Cartagena, sigue sin solucionarse, y la transformación de nuevas superficies agrícolas de regadío en la zona Sur del Mar Menor podrían aumentar el problema.Las asociaciones ANSE y WWF han documentado el preocupante estado de los fondos lagunares del Mar Menor.