Isco ha sido galardonado con el premio Golden Boy 2012, que cada año hace entrega el reconocido diario deportivo italiano Tuttosport y que premia al mejor Sub-21 que juega en Europa. Isco se ha impuesto en la votación con un total de 137 votos, por delante del futbolista italiano-egipcio Stephan El Shaarawy, del Milán, con 125 votos, y del portero Thibaut Courtois, que del Atlético de Madrid (cedido por el Chelsea), con 116 votos.
