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Análisis genómico de la propagación del COVID-19. Reporte al 27-03-2020

Analizamos 1,495 genomas de COVID-19 compartidos públicamente. Comparando estos genomas entre sí, podemos caracterizar cómo COVID-19 se está moviendo alrededor del mundo y propagando localmente. Actualizaciones de esta semana: Europa Seguimos viendo una fuerte mezcla de muestras en Europa. Esto sugiere que el virus ha seguido moviéndose a través de las fronteras en las últimas 3-5 semanas. A medida que las medidas de mitigación surtan efecto, podremos ver más agrupación de casos por país. América del Norte Dentro de los EE.UU., los

| etiquetas: análisis , genómico , covid-19 , propagación , mundial
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47 comentarios
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Comentarios destacados:            
  1. #1 --523080--
    ¿Alguien me lo traduce por favor? Es para un amigo que no entiende de análisis genómicos...
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  2. pingON #2 pingON
    #1 te sirve para ver cómo se ha expandido el virus
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  3. gonas #3 gonas
    Vamos a morir todos {0x1f631}

    Y ahora en serio. ¿Alguien que entienda nos puede explicar como utilizan esto los investigadores?
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  4. ctrl_alt_del #4 ctrl_alt_del *
    #1 Las infecciones de Italia y España llegaron de Alemania y Reino Unido, probablemente a traves del tránsito de ejecutivos desde estos países a Wuhan. Los genotipos no mienten.

    Más información en este artículo, basado también en los resultados de NextStrain: blogs.publico.es/otrasmiradas/30966/la-propagacion-del-coronavirus-por
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  5. #5 surco *
    Hombre el artículo está bien, salvo por lo irritante que resulta que al referirse a América del Norte solo hable de USA y que diga que hay 6 continentes ( a mi solo me salen 4, salvo que contemos la Antártida como otro), por lo demás es interesante.
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  6. porquiño #6 porquiño
    Pedazo trabajo!!! Está genial!!! Datos y datos
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  7. #7 --597761-- *
    #4 buenísimo el artículo, recomiendo leerlo al que no lo haya hecho. Lo leí hace un par de días por un familiar que me lo paso. Muy muy recomendable.
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  8. #8 --597761--
    #3 go to #4
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  10. saren #10 saren
    #4 No me cuadra o no lo entiendo bien. ¿Y por qué salen tantos de Islandia?
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  12. emegece #12 emegece
    #5 contando la Antártida, son seis.
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  13. gonas #13 gonas *
    Gracias por la aclaración.

    ¿Cuando hablas de porcentajes a que te refieres, a probabilidad del origen?
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  14. strangeoutsider #14 strangeoutsider
    #10 A Islandia parece ser que llegó a través de turistas que estuvieron en una estación alpina austriaca en la que hubo muchos contagios.
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  15. #15 fpove
    #1 Que nos infectaron alemanes e ingleses que fueron a China.
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  16. #16 --597761--
    #11 no lo llegué a ver por aquí, y no entiendo esa cantidad de negativos que se llevó. He alucinado cuando he visto los treinta y tantos negstivos...
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  17. Battlestar #17 Battlestar
    Valencia ha exportado mogollon, y eso sin fallas, imaginaos si llegan a celebrarse xD
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  18. #18 fpove
    #3 Por ejemplo demuestra que Italianos y Españoles nos infectaron Alemanes e Ingleses que fueron a China; sirve porque puede "trazar" la evolucion del virus, asi como detectar los focos de propagacion y de infeccion.
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  19. #19 surco
    #12 Si consideras América 1 y Euroasia otro me salen 4 más la Antártida 5
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  20. powernergia #20 powernergia *
    #10 Es el país que más secuenciaciónes genéticas ha hecho, y por tanto el que más información aporta:

    www.infobae.com/america/tendencias-america/2020/03/27/cientificos-isla
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  21. #21 carraxe *
    #5 Europa
    Asia
    América
    África
    Oceanía
    En mis tiempos era así. Igual dividen las dos Américas
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  22. neo1999 #22 neo1999
    #17 Ya te digo. Así como permitir la manifestación del 8M fue un error, cancelar las fallas ha sido un acierto que ha salvado vidas.
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  23. Raziel_2 #23 Raziel_2 *
    #5 #13 ¿En serio? ¿No recordáis los continentes?
    America, Asia, África, Europa, Oceanía y la Antártida que también es un contiente, debajo del hielo hay suelo continental, a diferencia del Ártico en el que sólo hay hielo.
    En total 5, ni 4 ni 6.

    #19 ¿Te puedo preguntar porque quieres separar América y juntar Asia con Europa?
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  24. #24 mac31416
    #23 Esto... no es por nada, pero a mí me salen 6 con esos que dices.
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  25. Raziel_2 #25 Raziel_2
    #24 Si, si. Si es que no se contar, lo siento.
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  26. #26 nlllv
    #5 El tema de los continentes es, extrañamente, cultural:
    en.wikipedia.org/wiki/Continent#Number
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  27. thorin #27 thorin
    #16 Bueno, el artículo tiene un toque político que no habrá gustado a mucha gente, sumale que Público es un medio que tampoco gusta por sensacionalista. Y luego están las karmaputas que creyendo que se va a caer un meneo votan negativo para llevarse karma instantáneo.
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  28. Phonon_Boltzmann #28 Phonon_Boltzmann
    #21 No se trata de en tus tiempos sino de en tu cultura.
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  29. #29 mac31416
    Ha petado, efecto menéame, supongo. Heroku bien y todos esos nodos de node-red quedan muy bonitos, pero se agradecería un puto pdf aunque sea.
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  30. #30 carraxe
    #28 En mi cultura (algo obvio) y en el tiempo concreto en que se me enseñó, hace más de 30 años. Hay cosas que se enseñan de diferente manera
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  32. #32 --597761--
    #27 todo lo q comentas es cierto, pero es un artículo de opinión creo recordar. Hay partes políticas pero otras son objetivas, no entiendo tanto negativo. Lo del Karma siempre me pareció de lo más imbécil posible. Pero seguramente hayas clavado las causas.
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  33. #33 --214250--
    #17 La mierda del partido contra el Atalanta que el Valencia pidió aplazar ha hecho que el virus explote en Italia y en España.

    La UEFA es responsable directa de esto.
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  35. #35 A_Galopar
    #11 Los primeros casos de Burgos llegaron desde La Rioja según la prensa.
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  36. #36 A_Galopar *
    #35 #11 Yo apostaría que tiene que ver con la industria del vino (enólogía, viticultura)
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  37. #37 --639751--
    #4 y como se sabe que eran ejecutivos?
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  38. berkut #38 berkut
    #4 Entonces Inglaterra y Alemania se contagiaron antes que Italia?
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  39. #39 surco
    #21 #23. Ellos si, y efectivamente siempre hemos separado Europa y Asia, pero Por que? Por la misma razón que ellos han separado América del Norte y América del sur. Motivos culturales, raciales, políticos...pero no geográficos.
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  40. Samu__ #40 Samu__
    ¿Implicaciones sobre la viabilidad de una vacuna Universal teniendo en cuenta toda esta variabilidad en tan pocos meses?
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  41. ctrl_alt_del #41 ctrl_alt_del
    #37 #38 leed el artículo
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  43. #43 VendoOpelCorsa
    #18 Lo que significa que alli, estan mas jodidos que en Italia y España, pero lo contabilizan como las emisiones de VW.
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  44. #44 --38321--
    #21

    Pues debiste prestar poca atención en clase, eso sería en tiempos de mi abuelo porque cuando yo estaba en la EGB (y tengo 52 tacos) aparte de la "tradicional" de cinco continentes (que en realidad eran seis porque faltaba la Antártida) ya se hablaba:
    - Viejo Contiente. Eurasia + Africa (es.wikipedia.org/wiki/Eurafrasia)
    - Nuevo Contienente: América
    - Novísimo: Oceanía (Australia + islas)
    - Continente Austral: Antardida.

    Y como dice #39, no tiene sentido separar Asia de Europa ¿qué lo separa? ¿Los Urales? ¿El Caucaso? Pues por la misma regla de tres separamos la India de Asia que tiene el Himalaya en medio, España de Europa (Pirineos), Andalucía de España (Sistema Bético), .....
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  45. #45 carraxe
    #44 Tú sí que prestas atención, aunque respondiendo a más de una semana vista habrás tenido tiempo de prepararte la respuesta. Y aún así... MEEEEEC. Lo de Eurasia está muy bien para 1984, de Orwell, pero así no se estudiaba. Y no, no contaba con África, por mucho que hayas encontrado una referencia en la Wikipedia, bastante trasnochada.
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  47. #47 VendoOpelCorsa
    #16 Bot de VOX...
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