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Clave para producción rentable de etanol, revelada por secuenciación genómica

El C. thermocellum es un microorganismo que tiene la capacidad de transformar la biomasa en etanol en un solo proceso, pero no se emplea a escala industrial porque el primer paso mismo, degradar la celulosa vegetal, es demasiado ineficiente. Sin embargo, productos de desecho tales como hierba cortada y astillas de madera, que siempre se han considerado demasiado difíciles de convertir en etanol, podrían muy pronto ser ofrecidos a bacterias hambrientas genéticamente modificadas.
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Por primera vez, científicos españoles van a secuenciar el genoma de una planta (el melón)

Por primera vez, científicos españoles van a secuenciar el genoma de una planta, en este caso, el melón, que es el segundo cultivo más importante en España. La iniciativa la van a llevar a cabo cinco comunidades autónomas que contarán con una inversión de cuatro millones de euros. España tendrá por primera vez acceso a una de las tecnologías más complejas, que hasta hace poco solo estaba en manos de grandes potencias como EEUU, Francia Japón o el Reino Unido
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La secuenciación de un genoma humano africano y otro asiático abre la vía a la genómica personal

La secuenciación del genoma de un hombre africano y de uno asiático vienen a unirse a los ya secuenciados de J.D. Watson y J.C. Venter, ambos de origen europeo y abren la vía al análisis de la variación genómica en las distintas etnias humanas. La revista 'Nature' publica esta semana los resultados de los dos equipos de científicos que han trabajado en la secuenciación de ambos genomas mediante la técnica 'Illumina', que pertenece a una nueva y más potente generación de tecnologías de secuenciación genómica.
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El coste de secuenciar tu genoma cae a tan sólo 5000 dólares

A James Watson, el descubridor de la estructura en doble hélice del ADN, la secuenciación de su genoma le costó un millón de dólares en el año 2007. El año pasado, la compañía Applied Biosystems, anunció la secuenciación del genoma de un nigeriano por sólo 60.000$. Pero, ahora la empresa Complete Genomics, ha bajado este coste a la décima parte, cualquier compañía o investigador podrá secuenciar un genoma humano por sólo 5.000$ a partir de junio de este año... Además, Complete Genomics podría ser ganador del Archon Genomics X Prize.
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Una empresa de EEUU ofrecerá a partir de junio la secuenciación de genomas por unos 3.900 euros

La compañía californiana Complete Genomics (CG) ha presentado en un congreso celebrado en Florida (EEUU) el primer genoma humano de bajo coste, obtenido mediante tecnología de secuenciación de tercera generación y que rivaliza en calidad con el del padre del ADN James Watson, completado hace dos años por 775.000 euros. CG ha anunciado para junio de este año el lanzamiento de su servicio comercial de secuenciación de genomas por unos 3.900 euros.
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Empresas españolas podrían secuenciar el genoma completo de particulares «en tres años»

El director del Instituto Valenciano de Genética (IVGEN), el profesor Manuel Pérez Alonso, aseguró que empresas españolas dedicadas a los análisis genéticos podrían ofrecer servicios de secuenciación completa de genoma a particulares "en unos tres años", de conseguirse implantar en nuestro país las nuevas tecnologías de secuenciación masiva que funcionan ya en Estados Unidos, y cumplirse dentro de este plazo, los trámites legales para aplicar las técnicas.
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Ya puedes secuenciar tu genoma (parcialmente) gratis <ENG>

Traducción: Se puede tener el genoma secuenciado (parcialmente) gratis por participar en un programa de investigación a gran escala que intenta correlacionar genes con enfermedades. El Coriell Personalized Medicine Collaborative (CPMC) está patrocinado por organizaciones caritativas y tiene dinero para secuenciar a 10.000 voluntarios.
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Secuenciación y primer análisis del genoma de la vaca

Un consorcio internacional de investigadores ha presentado el genoma de la vaca (Bos taurus). Su plano genético ha sido también objeto de un primer análisis. Esta primera e importante investigación será de ayuda para los esfuerzos encaminados a producir mejor carne de ternera y mejores productos lácteos, y conducirá también a un mayor conocimiento del genoma humano.
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Genética e internet en español

El empresario Alejandro Suárez está desarrollando Genolab, un laboratorio de genética que va a ofrecer el servicio de secuenciación del ADN y la propia gestión de la información genética de los usuarios. Aunque ya hay cuatro 4 empresas que ofrecen este tipo de servicios, Genolab pretende generar una gran base de datos con las secuencias de personas sanas.
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1 máquina y 4 semanas, suficientes para secuenciar el genoma humano [Eng]

Investigadores han utilizado una nueva máquina, Helicos, que secuencia millones de fragmentos de ADN en paralelo para alcanzar el 90% del genoma de un individuo en sólo 4 semanas.
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Todavía no se ha completado la secuenciación del genoma humano completo

En el año 2000 se anunció la secuenciación del borrador completo del genoma humano. En 2003 se dió por finalizada la secuenciación, publicada en 2004. En 2006 se volvió a anunciar una versión más completa. Sin embargo, en marzo de 2009 todavía no se había logrado secuenciar el genoma humano completo. Se estima que hay unos 300 huecos sin conocer que totalizan entre 300 y 700 millones de nucleótidos (bases).
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Nuevo método más rápido y barato de secuenciación del ADN [ENG]

Un equipo de investigadores liderado por Amit Meller, ingeniero biomédico de Boston University usa campos eléctricos para dibujar largas hebras de ADN a través de sensores de nanoporos reduciendo drásticamente el número de copias de ADN requeridas para un análisis de alto rendimiento.
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Científicos secuencian el mapa genético de un esquimal que vivió hace 4.000 años  

WASHINGTON (Reuters) - Los científicos han secuenciado el ADN de cuatro cabellos congelados de un groenlandés que murió hace 4.000 años en un estudio que afirman que abre nuevos horizontes en la tecnología genética. Sorprendentemente, el hombre parece proceder de Siberia y no está relacionado con los groenlandeses modernos, según los hallazgos de Morten Rasmussen y sus colegas de la Universidad de Copenhague.
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Las empresas especializadas en secuenciación de genoma humano compiten por lograr que cuesten sólo 1000 $

Si tenemos en cuenta que la secuenciación del primer genoma humano costó alrededor de 3 mil millones de dólares y, justo ahora, secuenciar un genoma puede costar entre 5.000 y 15.000 dólares, nos podremos dar cuenta de que estamos casi en la recta final. Además, aquella empresa que consiga secuenciar 100 genomas en 10 días a un precio de 10.000 $ por genoma se llevará a casa un premio de 10 millones de dólares de parte de la Fundación X Prize y el reconocimiento de haber marcado un hito.
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El CSIC investiga la secuenciación del genoma de lagos catalanes frente al cambio climático

Investigadores del CEAB pertenecientes al CSIC buscan desvelar la secuenciación masivam del genoma de los lagos catalanes para predecir el comportamiento de los organismos frente al cambio climático. Según informó en un comunicado, esta investigación busca secuenciar millones de secuencias de ADN para revelar el metagenoma de los lagos, entendido como un superorganismo formado por diferentes componentes que funcionan al unísono y descubrir, con ello, su funcionamiento.
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Un proyecto para secuenciar el genoma de 100.000 personas [ING]

El científico de Harvard George M. Church ha cofundado o es consultor de unas 22 empresas enfocadas a asuntos como biología sintética, secuenciación genética y proveedores de test genéticos a consumidores. El proyecto ha sido posibilitado por el enorme aumento de la velocidad y eficiencia de la secuenciación, y el anterior coste prohibitivo de millones de dólares de un genoma de hace dos años ha caído por debajo de 10.000 dólares hoy. "El objetivo no es saber de qué mueres, sino cómo actuar para prevenir enfermedades".
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10 años de la secuenciación del genoma, el mayor acontecimiento científico de nuestra época

El Mundo ha hecho un especial de este aniversario. La secuenciación del ADN es un hito científico que muchos pensaron cambiaría la Biología y la Medicina tal y como las conocíamos. Sin embargo, en lo que a la práctica clínica se refiere, esos resultados van a tardar en llegar. ¿Decepción?
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Secuencian por primera vez el genoma irlandés

Los irlandeses son genéticamente distintos de los demás europeos, incluidos sus vecinos británicos. Ahora, por primera vez, se ha secuenciado el genoma de un irlandes, que posee una gran cantidad de variaciones genéticas respecto a los demás. El equipo responsable de la investigación afirmó que el sujeto irlandés poseía unas 400 000 nuevas mutaciones simples en el ADN, de las cuales 8 000 parecen heredarse junto con genes que influyen en trastornos como enfermedades que provocan inflamación intestinal y problemas hepáticos.
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El grafeno se muestra capaz de acelerar la secuenciación del ADN

[c&p] En un artículo publicado en la portada de Nature, investigadores de la Universidad de Harvard y del MIT, han demostrado que el grafeno de carbono de tan sólo un átomo de espesor puede actuar como una membrana artificial que separa dos depósitos de líquido. Perforando un pequeño poro de sólo algunos nanómetros de diámetro, llamado nanoporo, en la membrana de grafeno, fueron capaces de medir el intercambio de iones a través del poro, demostrando así que una molécula larga de ADN puede ser forzada a pasar, a través del nanoporo de grafeno
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Frederick Sanger, el único hombre en ganar dos premios Nobel de química

Desde que se doctoró, la carrera de Sanger no ha parado de traer enormes éxitos y descubrimientos que le acabarían haciendo merecedor de dos premios Nobel. Sus aportes no sólo a la química, sino también a la biología, permitieron un avance enorme de la genética y la bioquímica. Principalmente, sus hitos fueron tres, los cuales iremos viendo detenidamente a lo largo del artículo: El descubrimiento de que las proteínas tienen una estructura definida, investigaciones sobre el ARN y un método de secuenciar el ADN.
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Secuenciación masiva, bacterias y virus

Aunque se están realizando grandes esfuerzos para que la secuenciación masiva del cáncer pueda tener una aplicación práctica, todavía falta para que se utilize en los hospitales para el beneficio de los pacientes. Sin embargo, las secuencias de bacterias y virus están empezando a generar ya aplicaciones clínicas importantes.
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El uso de la secuenciación completa del genoma podría mejorar la supervivencia de los pacientes con cáncer

Ahora cuesta entre 21.000 y 28.000 euros, pero los precios están cayendo y en 10 años su precio podría ser menor de 7.000 euros. Las tasas de supervivencia al cáncer podrían mejorar pronto gracias a la secuenciación completa del genoma, según dos estudios que se publicarán el próximo 20 de abril en 'Journal of the American Medical Association', que describen las primeras aplicaciones clínicas de este proceso de alta tecnología en pacientes con esta enfermedad.
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¿Cómo se puede identificar a alguien como Bin Laden?

No estoy totalmente seguro del tipo de análisis que utilizaron, pero puedo decir con certeza que fuese cual fuese pudo completarse en pocas horas. Utilizando métodos PCR -los cuales son los que uso en mi laboratorio todos los días- se puede identificar un cadáver en poco tiempo. ¡Joder! Si yo puedo analizar ADN de un pez en 24 horas, estoy seguro de que el Gobierno puede hacerlo en menos tiempo. Aquí explico cómo.
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Archipiélago danés lanza plan de secuenciación masiva [ING]

Los habitantes de las Islas Feroe podrían convertirse en la primera población del mundo que obtiene la secuenciación completa de su genoma de forma gratuita, según anunciaron investigadores en una reunión sobre los genomas personales en el Cold Spring Harbor Laboratory, la semana pasada. El proyecto, denominado FarGen, pretende secuenciar el genoma completo de todos los ciudadanos y utilizar la información para el cuidado de la salud y la investigación en la dependencia autónoma danesa.
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En la recta final, secuenciación de bacteria implicada en VIH

Con el estudio del metabolismo de la Mycobacterium colombiense concluirá, hacia mayo del 2012, la secuenciación de su genoma, permitiendo mejorar tratamientos en pacientes con diversas patologías. Esta bacteria afecta a las personas cuando sus defensas están bajas, y en los casos de pacientes con VIH, ataca produciendo desde diarreas intermitentes hasta infecciones en los pulmones. También se presenta en personas con linfoadenopatía cervical (inflamación de los ganglios).
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